《农村土地承包法》第38条规定：“土地承包经营权采取互换、转让方式流转，当事人要求登记的，应当向县级以上地方人民政府申请登记。未经登记，不得对抗善意第三人。”根据该条规定可知：（1）登记限于互换和转让流转。采取互换、转让方式流转的，当事人要求登记的应准予登记。《物权法》第129条规定：“土地承包经营权人将土地承包经营权互换、转让，当事人要求登记的，应当向县级以上地方人民政府申请土地承包经营权变更登记；未经登记，不得对抗善意第三人。”因为互换和转让的土地承包经营权主体发生了改变，而转包、出租的土地承包经营权主体没有发生改变。另外，物权法的规定采用了登记对抗模式。也就是说，土地承包经营权人通过互换转让方式流转了土地承包经营权后，如果不登记，该项权利是生效的，但是不能对抗善意第三人；如果登记了，就可以产生绝对对抗任何人的效果。（2）登记是一种申请行为。只有当事人要求登记才给予办理，不像家庭承包由县级主管部门直接颁发土地承包经营权证。申请进行土地使用权流转登记，应当提交变更登记申请书以及相关资料。登记部门收到申请及文件后，经调查、审核，符合变更登记规定的，报人民政府批准后，变更注册登记，更换或者更改土地承包经营权证书。（3）登记受理的单位是县级以上人民政府农业行政主管部门。（4）不强制当事人登记。