（一）划拨用地上土地用途改变为商品住宅，或由用地单位自行申请改变为经营性用途进行新建的，按照12号文第（四十九）点第3（1）小点关于改变土地用途收回土地使用权的规定，由政府收回土地使用权后公开出让，并按照评估的原划拨用地市场价格补偿。（二）划拨用地上除土地用途改变为商品住宅外，因规划调整而非用地单位自行申请改变土地用途，且经政府批准不收回土地使用权的，参照12号文第（四十九）点第3（2）小点关于改变土地用途补交土地出让金的规定，应当补交的土地出让金额=改变用途后的市场评估地价-评估的原划拨用地市场价。 
（三）已出让用地上因规划调整而非用地单位自行申请改变土地用途，且经政府批准不收回土地使用权的，按照12号文第（五十六）点关于调整建筑面积补交土地出让金的规定，出让合同有约定的，从其约定；没有约定的，按各类用途面积增减情况计算补交的土地出让金，如计算的补交土地出让金额减少，不作退减。（市场评估楼面地价的估价时点为案件受理之日并进行年限修正，土地出让起始时间为已出让设定的出让起始时间）