第一，我国耕地土壤肥力水平整体偏低。耕地土壤有机质含量低于1%的面积占26%。与欧洲土壤相比，我国耕地土壤的有机质含量不及欧洲同类土壤的一半。中低产田面积占全国耕地面积的70%。按联合国的划分方法，我国耕地有障碍的占89%，无障碍耕地仅占11%。


第二，耕地土壤退化面积较大，而且水土流失、土壤酸化等现象大多在继续扩展。其中，我国水土流失面积367万公顷，平均年增1万公顷。土壤退化突出表现在：耕层变薄，致使土壤透水透气性差，保水保肥能力降低。华北地区农田土壤耕层低于15厘米的占11.9%，犁底层加厚至5~8厘米。有机质含量偏低，区域不平衡加剧。近20年来，由于秸秆还田的面积和数量的增加，总体上我国农田土壤有机质含量基本保持稳定或有所增加，但不同区域有差异，其中东北土壤有机质平均含量下降较快，红壤地区土壤酸化趋势较为明显。


第三，土壤污染严重。目前，我国面临的土壤环境安全问题日渐突出。固体废弃物如秸秆、塑料、固体生活垃圾、干性有机肥等处置不当，均可成为农业生态系统中的固体废弃物。


第四，耕地占优补劣比较普遍。根据国土资源部门的资料统计，我国平均每10年通过土地开发、土地整理和土地复垦补充耕地4200～7350万亩，但这些耕地一般多属于低产田，土壤理化性状差，土壤肥力与生产水平均很低，需要加大培育基础地力。